当发现新生儿发烧39度时，以下是一些建议的处理方法：
1.测量体温：使用可靠的体温计测量宝宝的体温，确保测量方法正确。
2.松解衣物：确保宝宝穿着宽松、轻便的衣物，避免过多的衣物影响散热。
3.补充水分：给宝宝适量的液体，如白开水或母乳，以防止脱水。
4.物理降温：可以采用温水擦拭身体、使用退热贴等方法来帮助降低体温，但要注意避免过度冷却宝宝。
5.及时就医：如果宝宝的体温持续升高或出现其他异常症状，如呼吸急促、咳嗽、哭闹不止等，应立即带宝宝去看医生。医生会根据宝宝的具体情况进行进一步的诊断和治疗。
需要注意的是，对于新生儿的健康问题，最好咨询专业的医生或儿科专家的意见。他们能够根据宝宝的具体情况提供准确的诊断和治疗建议。此外，在处理宝宝的发烧问题时，要密切观察宝宝的情况，确保其舒适和安全。如果有任何疑虑或担忧，不要犹豫，及时寻求医疗帮助。