头发里长疙瘩摸起来疼，可能是以下原因引起：
1.毛囊炎：
是由细菌感染引起的毛囊炎症，常发生于头皮、眉毛、睫毛、腋窝和生殖器等部位。
症状包括毛囊周围的红色丘疹、脓疱，伴有疼痛和瘙痒。
病因可能与细菌感染、毛发牵拉、搔抓、皮肤损伤、免疫力下降等有关。
治疗方法包括外用抗菌药物（如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等）、口服抗生素（如头孢呋辛酯、阿莫西林等），严重者可能需要切开引流。
2.疖肿：
是一种由金黄色葡萄球菌感染引起的皮肤深部毛囊及其周围组织的化脓性炎症。
好发于头面部、颈部和臀部等部位。
症状为红肿、疼痛的结节，逐渐隆起，数日后中央变软，出现波动感，顶部出现黄白色点状脓栓。
治疗方法与毛囊炎相似，严重者可能需要手术切开排脓。
3.皮脂腺囊肿：
是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。
好发于头面部、背部和臀部等部位。
囊肿呈圆形，边界清楚，质地柔软，无压痛，可以推动。
感染时可出现红肿、疼痛，甚至化脓。
治疗方法主要是手术切除。
4.其他：
头发里长疙瘩摸起来疼还可能是其他疾病引起，如脂肪瘤、表皮样囊肿、皮肤纤维瘤等。
此外，恶性肿瘤如基底细胞癌、鳞状细胞癌等也可能出现类似症状。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体病因需要根据患者的具体情况进行诊断。如果疙瘩持续不愈或加重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，并根据医生的建议进行治疗。同时，要注意保持头皮清洁，避免搔抓和挤压疙瘩，以免加重病情。