早上起床吐痰是褐色的，可能是以下原因引起：
1.环境因素：
长期生活在空气质量较差的环境中，如工业污染、粉尘较多的地区，可能会导致呼吸道长期受到刺激，使痰液呈现褐色。
气候干燥，空气湿度较低，可能会导致呼吸道黏膜干燥，使痰液中的血液凝固，从而使痰液呈现褐色。
2.呼吸道疾病：
感染：如肺炎、支气管炎等，可能会导致呼吸道黏膜充血、水肿，甚至出现炎症，使痰液中含有血液，从而使痰液呈现褐色。
肺结核：肺结核是由结核分枝杆菌引起的呼吸道传染病，患者可能会出现咳嗽、咳痰、咯血等症状，其中咯血是肺结核的常见症状之一，咯出的血液在呼吸道内停留时间较长，会使痰液呈现褐色。
肺癌：肺癌是肺部的恶性肿瘤，早期可能没有明显症状，随着病情的进展，可能会出现咳嗽、咳痰、咯血等症状，其中咯血是肺癌的常见症状之一，咯出的血液在呼吸道内停留时间较长，会使痰液呈现褐色。
3.心血管疾病：
心力衰竭：心力衰竭是由于心脏的收缩功能或舒张功能发生障碍，导致静脉回流受阻，动脉系统供血不足，从而引起的一系列症状。心力衰竭患者可能会出现肺部淤血，导致咳嗽、咳痰，其中咯出的血液在呼吸道内停留时间较长，会使痰液呈现褐色。
肺动脉栓塞：肺动脉栓塞是由于栓子阻塞肺动脉或其分支，导致肺部血液循环障碍，从而引起的一系列症状。肺动脉栓塞患者可能会出现呼吸困难、胸痛、咯血等症状，其中咯血是肺动脉栓塞的常见症状之一，咯出的血液在呼吸道内停留时间较长，会使痰液呈现褐色。
4.其他：
血液系统疾病：如血小板减少性紫癜、白血病等，可能会导致凝血功能障碍，使呼吸道黏膜容易出血，从而使痰液呈现褐色。
使用某些药物：如抗血小板药物、抗凝药物等，可能会导致凝血功能异常，使呼吸道黏膜容易出血，从而使痰液呈现褐色。
如果出现早上起床吐痰是褐色的情况，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸部X线或CT等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，应注意休息，避免劳累和吸烟等不良习惯，保持呼吸道湿润，多饮水，有助于痰液的咳出。