阴茎上起小痘痘可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的情况：
1.珍珠状阴茎丘疹：这是一种常见的良性病变，表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现珍珠状、半透明的小丘疹，通常无自觉症状，可能与生理发育上的变异或局部刺激有关。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。病变初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。疣体常发生糜烂、渗液，有恶臭。
3.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，主要通过性接触传播。初起为多个成群的红色小丘疹，并迅速变为水疱，疱液先透明后混浊，疱壁易破，形成糜烂或溃疡，自觉疼痛。
4.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。
5.皮脂腺异位症：病因不明，可能与内分泌因素、局部刺激或创伤有关。表现为粟粒大小的淡白色丘疹，无自觉症状。
6.扁平湿疣：是二期梅毒的一种表现，主要通过性接触传播。扁平湿疣多发生于肛周、外生殖器等部位，表现为圆形或椭圆形斑块，表面湿润，有蜡样光泽，可伴有糜烂、渗出。
7.其他：阴茎上起小痘痘还可能与药物过敏、局部感染、湿疹等有关。
如果发现阴茎上有小痘痘，应及时就医，明确诊断。医生会根据具体情况进行相应的检查和治疗。同时，要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓和摩擦，避免不洁性生活。