去牙结石牙膏存在一些问题，比如清洁效果有限、无法替代专业治疗等。
清洁效果有限
一般来说，去牙结石牙膏的清洁能力相对较弱，它只能对一些表面较浅的污垢有一定清洁作用，对于顽固且已形成较厚的牙结石，仅靠牙膏很难将其彻底清除。
无法替代专业治疗
牙结石是由牙菌斑、食物残渣等长期钙化形成的，专业的口腔治疗，如洗牙（龈上洁治术）才能有效去除牙结石，去牙结石牙膏不能替代洗牙等专业的口腔治疗手段来解决牙结石问题。
个体差异影响效果
不同人群的口腔状况不同，有些人可能使用去牙结石牙膏后感觉效果不明显，这是因为每个人的口腔环境、牙结石形成程度等存在个体差异，导致牙膏在不同人身上的清洁效果有别。
长期使用的局限性
长期依赖去牙结石牙膏并不能从根本上预防牙结石的再次形成，而且其成分对牙齿和牙龈的长期影响也需要进一步观察，不能单纯依靠它来维护口腔健康。
特殊人群需谨慎
对于一些口腔敏感人群，如患有牙龈炎、牙龈萎缩等疾病的患者，使用去牙结石牙膏可能会刺激牙龈，加重不适症状，这类特殊人群使用时需格外谨慎，最好先咨询医生建议。