自闭症的病因尚未完全明确，目前认为是遗传因素与环境因素共同作用的结果。遗传因素在自闭症发病中占据重要地位，研究发现多个基因的突变或变异可能增加自闭症的发病风险。同时，环境因素也不可忽视，如孕期母亲接触某些有害物质、分娩时的并发症等都可能与自闭症的发生相关。
遗传因素主导
大量研究表明，遗传因素对自闭症的影响显著。同卵双胞胎中自闭症的同病率远高于异卵双胞胎，提示遗传因素在其中起关键作用。已发现多个与自闭症相关的基因位点，这些基因可能影响大脑的发育和神经递质的传递等过程，从而导致自闭症的发生。
孕期环境影响
孕期母亲的健康状况对胎儿发育至关重要。孕期母亲感染某些病毒，如风疹病毒等，可能增加胎儿患自闭症的风险。此外，孕期母亲接触化学毒物、吸烟、饮酒等不良行为，也会干扰胎儿神经系统的正常发育，增加自闭症发生几率。
分娩相关因素
分娩过程中的一些并发症也与自闭症有关。例如早产、低出生体重、难产等情况，可能影响胎儿大脑的正常结构和功能发育，进而增加自闭症的发病可能性。
产后早期环境
婴儿出生后的早期环境也可能对自闭症产生影响。如早期缺乏足够的情感互动、不良的养育方式等，可能在遗传易感性的基础上，促使自闭症症状的显现和发展。但这类环境因素的影响相对遗传因素而言，作用机制较为复杂，需要综合多方面因素进行考量。