肛门外长有小肉疙瘩并伴有疼痛，可能是外痔、肛裂、肛周脓肿等疾病引起，止痛方法主要包括以下几方面。
1.一般治疗
调整饮食：避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、胡椒、芥末等，以免加重疼痛。多吃蔬菜、水果、粗粮等富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，防止便秘。
注意卫生：保持肛门清洁，便后用温水清洗，避免感染。
卧床休息：疼痛时应卧床休息，减少活动，避免久坐、久站。
缓解疼痛：可以用热毛巾或热水袋热敷肛门，缓解疼痛。
2.药物治疗
外用药物：在医生的指导下，使用痔疮膏、痔疮栓等药物，直接作用于肛门，缓解疼痛。
口服药物：如果疼痛严重，可以口服止痛药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
抗生素：如果是肛周脓肿引起的疼痛，需要使用抗生素进行抗感染治疗。
3.手术治疗
外痔切除术：如果是外痔引起的疼痛，需要进行外痔切除术，切除外痔组织。
肛裂切除术：如果是肛裂引起的疼痛，需要进行肛裂切除术，切除肛裂组织。
肛周脓肿切开引流术：如果是肛周脓肿引起的疼痛，需要进行肛周脓肿切开引流术，排出脓液，缓解疼痛。
需要注意的是，肛门外长有小肉疙瘩并伴有疼痛，可能是其他疾病引起，如肛管或直肠肿瘤等。因此，在进行止痛治疗的同时，需要及时就医，明确病因，进行针对性治疗。