怀孕40天做B超不一定能看出来。一般情况下，怀孕40天时，孕囊可能还没有到达子宫，或者孕囊内还没有胎芽和胎心搏动。但如果月经周期比较短，或者受精卵着床比较早，也有可能在怀孕40天的时候通过B超看到孕囊。
需要注意的是，过早做B超可能会因为孕囊太小而看不清，而且频繁做B超也可能会对胎儿造成不良影响。因此，如果没有特殊情况，建议在怀孕6-8周时再做B超，此时孕囊已经足够大，可以清晰地看到胎芽和胎心搏动，从而确定胎儿是否正常发育。
此外，怀孕40天还可以通过其他方法来确定是否怀孕，如验孕棒或验孕试纸检测、血HCG检测等。这些方法都可以在一定程度上帮助判断是否怀孕，但最终的确诊还是需要依靠B超检查。
如果对自己的怀孕情况有任何疑问，建议及时咨询医生，医生会根据个人情况提供专业的建议和指导。同时，在怀孕早期，要注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持良好的心态，有助于胎儿的健康发育。