三个月宝宝坐飞机可能会有以下危害：
1.气压变化：飞机在上升和下降过程中，气压会发生明显变化，可能导致宝宝耳部不适。三个月的宝宝耳部发育尚未完善，咽鼓管较短、宽且平直，鼻咽喉部的细菌容易通过咽鼓管进入中耳，引发中耳炎，出现耳痛、哭闹、烦躁、摇头等症状。
2.缺氧：高空的氧气含量相对较低，可能会影响宝宝的氧气供应，导致宝宝出现呼吸急促、心跳加快等不适症状。
3.感染：飞机上人员密集，空气流通不畅，宝宝容易感染呼吸道疾病。
4.环境陌生：宝宝对陌生环境可能会感到不安，哭闹不止。
因此，如果没有特殊情况，建议三个月的宝宝尽量避免坐飞机。如果必须坐飞机，家长可以采取以下措施：
1.在飞机起降时，给宝宝喂奶或喂水，缓解耳部不适。
2.确保宝宝穿着舒适、保暖，避免着凉。
3.携带宝宝常用的物品，如奶瓶、奶嘴、尿布等，以减少宝宝的不适。
4.注意观察宝宝的情况，如有异常及时寻求帮助。
总之，家长应该根据宝宝的具体情况，权衡利弊，谨慎决定是否让三个月的宝宝坐飞机。如果对宝宝的健康有任何疑虑，最好咨询医生的意见。