半夜起来上厕所头晕，可能是以下原因引起：
1.体位性低血压：从卧位到站立位时，血压突然下降，导致大脑供血不足，从而引起头晕。这在老年人、长期卧床者或服用降压药的人群中较为常见。
2.低血糖：半夜起床后，由于长时间未进食，可能导致低血糖，引起头晕、乏力等症状。
3.内耳性眩晕：内耳前庭器病变导致的眩晕，常伴有听力下降、耳鸣等症状。
4.颈椎病：颈椎病变可能压迫椎动脉，导致大脑供血不足，从而引起头晕。
5.其他原因：贫血、心律失常、心力衰竭等也可能导致半夜起床后头晕。
如果经常出现半夜起来上厕所头晕的情况，建议及时就医，进行全面的检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，也可以采取以下措施来预防头晕的发生：
1.改变体位时，动作要缓慢，避免突然改变体位。
2.合理饮食，避免长时间禁食。
3.戒烟限酒。
4.积极治疗原发病，如高血压、糖尿病、颈椎病等。
5.适当锻炼，增强身体素质。
需要注意的是，孕妇、老年人、患有心血管疾病等人群，如果出现半夜起来上厕所头晕的情况，应及时就医，以免发生意外。