同房的时候肚子疼可能是盆腔炎、子宫内膜异位症、子宫肌瘤等原因引起的，可以通过药物、手术等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.盆腔炎：女性上生殖道感染引起的一组疾病，包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿和盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，最常见的是输卵管炎、输卵管卵巢炎。主要表现为下腹痛、阴道分泌物增多，腹痛为持续性，活动或性交后加重。若病情严重可有寒战、高热、头痛、食欲缺乏等全身症状。
2.子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的其他部位时，称为子宫内膜异位症。内异症的主要病理变化为异位内膜随卵巢激素变化而发生周期性出血，伴有周围纤维组织增生和粘连形成。病变多位于盆腔脏器和壁腹膜，以卵巢、宫骶韧带最常见，也可发生于子宫、直肠陷凹、骸韧带、阴道直肠隔等部位。典型症状为继发性痛经、性交痛、月经异常等。
3.子宫肌瘤：是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，也是人体最常见的良性肿瘤。常见于30-50岁妇女，20岁以下少见。根据肌瘤发生部位可分为子宫体肌瘤（约占90%）和子宫颈肌瘤（约占10%）。多数患者无明显症状，仅在体检时偶然发现。常见症状有经量增多、经期延长、下腹包块、白带增多、下腹坠胀、腰酸背痛等。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免性生活，同时要注意饮食清淡，避免食用辛辣、刺激性食物。可适当食用富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、牛奶、苹果、香蕉等。