熬夜时智齿疼痛，可能与以下原因有关：
1.免疫力下降：熬夜会导致身体免疫力下降，使口腔内的细菌更容易滋生和繁殖，从而引起智齿周围组织的炎症，导致疼痛。
2.口腔卫生不良：熬夜时，人体的唾液分泌减少，口腔自洁作用减弱，容易导致食物残渣和细菌在口腔内滋生，进而引发智齿冠周炎等口腔疾病，引起疼痛。
3.咬合关系不良：如果智齿生长位置不正，与对颌牙的咬合关系不良，可能会导致智齿萌出不全，部分牙龈覆盖在牙面上，形成盲袋，食物残渣和细菌容易在盲袋内滋生，引起智齿冠周炎，导致疼痛。
4.其他因素：熬夜时，人体的神经系统处于兴奋状态，可能会导致口腔内的肌肉紧张，加重智齿周围组织的炎症和疼痛。
针对熬夜时智齿疼痛的问题，以下是一些建议：
1.保持口腔卫生：在熬夜时，应尽量保持口腔卫生，及时刷牙、漱口，使用牙线、漱口水等工具清洁口腔，减少细菌滋生。
2.饮食调整：避免食用辛辣、刺激性食物，多吃新鲜的蔬菜和水果，补充维生素和矿物质，有助于提高免疫力。
3.多喝水：熬夜时应多喝水，保持口腔湿润，促进口腔内的血液循环和代谢，有助于缓解智齿疼痛。
4.注意休息：熬夜时应注意休息，保证充足的睡眠时间，提高身体免疫力，有助于缓解智齿疼痛。
5.就医治疗：如果智齿疼痛严重，影响正常生活和工作，应及时就医，进行口腔检查和治疗。医生可能会根据具体情况，给予药物治疗、局部冲洗上药、拔牙等治疗措施。
需要注意的是，孕妇、高血压、糖尿病等特殊人群，如果出现智齿疼痛，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，在日常生活中，应注意保持良好的口腔卫生习惯，定期进行口腔检查和洁治，及时发现和处理口腔问题，预防口腔疾病的发生。