新生儿呛咳和咳嗽的区别主要在于发生原因、表现和处理方法等方面，具体如下：
1.发生原因：呛咳通常是由于异物进入气管，刺激呼吸道引起的保护性反射；而咳嗽则可能由多种原因引起，如感染、过敏、气道刺激等。
2.表现：呛咳通常是突然发生的，伴有剧烈的咳嗽和喘息，有时可能会导致呼吸困难；咳嗽则可能表现为持续的、阵发性的咳嗽，咳嗽声音也可能不同。
3.处理方法：对于呛咳，应立即采取急救措施，如拍打背部、清除口腔异物等，以帮助排出异物；对于咳嗽，需要根据具体原因进行治疗，如抗感染、抗过敏、止咳等。
需要注意的是，如果新生儿出现呛咳或咳嗽，应及时就医，以便确定病因并采取适当的治疗措施。同时，家长应注意保持新生儿的呼吸道通畅，避免让其接触过敏原和刺激性物质。