同房第二天后小腹隐疼可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.生理因素：
性行为过程中，肌肉收缩和运动可能导致腹部肌肉疲劳或痉挛，引起小腹隐疼。
精液中的前列腺素可能引起子宫收缩，导致小腹不适。
2.妇科问题：
盆腔炎性疾病：是女性上生殖道感染引起的一组疾病，包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿和盆腔腹膜炎。可出现下腹疼痛、阴道分泌物增多等症状。
宫颈炎：子宫颈发生炎症时，可出现下腹或腰骶部疼痛，有时疼痛可出现在上腹部、大腿部及髋关节，每于月经期、排便或性生活时加重。
其他：子宫内膜异位症、子宫肌瘤、卵巢囊肿等妇科疾病也可能导致同房后小腹隐疼。
3.肠道问题：
肠痉挛：由于肠道受到刺激或痉挛引起的疼痛，常伴有腹部胀气、肠鸣音亢进等症状。
其他：肠炎、肠梗阻等肠道疾病也可能引起小腹疼痛。
4.其他因素：
膀胱炎：炎症刺激膀胱黏膜，可引起尿频、尿急、尿痛和小腹疼痛。
腹肌拉伤：在进行性行为时，如果腹部肌肉过度拉伸或用力不当，可能导致腹肌拉伤，引起小腹疼痛。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，小腹隐疼还可能与其他因素有关。如果疼痛持续不缓解、加重或伴有其他症状，如发热、阴道出血、白带异常等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体原因并采取相应的治疗措施。
对于女性，尤其是有性生活的女性，定期进行妇科检查非常重要，可以早期发现和治疗潜在的妇科问题。此外，保持良好的性生活卫生、避免过度劳累和压力、注意饮食健康等也有助于预防小腹疼痛的发生。
如果疼痛严重或持续时间较长，建议及时就医。医生会根据具体情况进行详细的问诊、体格检查和必要的辅助检查，如超声、妇科检查等，以明确病因并制定合适的治疗方案。在就诊时，应如实告知医生疼痛的特点、持续时间、伴随症状等信息，以便医生做出准确的诊断和治疗建议。同时，遵循医生的治疗方案，注意休息和个人卫生，有助于促进身体的康复。