13岁男孩阴茎发痒脱皮，可能与以下因素有关。
感染：
细菌感染：如果男孩没有注意阴茎部位的清洁卫生，可能会导致细菌感染，从而出现阴茎发痒、脱皮等症状。
真菌感染：如果男孩与他人共用了毛巾、浴盆等物品，可能会感染真菌，导致阴茎部位出现真菌感染，引起炎症反应，出现阴茎发痒、脱皮等症状。
过敏：
接触性皮炎：如果男孩对内裤、洗涤剂、避孕套等物品过敏，可能会导致阴茎部位出现过敏反应，引起炎症，出现阴茎发痒、脱皮等症状。
药物过敏：如果男孩服用了某些药物，如青霉素、磺胺类药物等，可能会导致过敏反应，引起阴茎部位出现炎症，出现阴茎发痒、脱皮等症状。
其他：
湿疹：如果男孩长期处于潮湿、闷热的环境中，或者患有其他疾病，如糖尿病、慢性肾病等，可能会导致阴茎部位出现湿疹，引起炎症，出现阴茎发痒、脱皮等症状。
银屑病：如果男孩患有银屑病，可能会导致阴茎部位出现银屑病皮损，引起炎症，出现阴茎发痒、脱皮等症状。
如果男孩出现阴茎发痒、脱皮等症状，家长应及时带其就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意保持男孩阴茎部位的清洁卫生，避免与他人共用毛巾、浴盆等物品，避免食用辛辣、刺激性食物。