百多邦和红霉素软膏都是常用的抗菌药物，各有优缺点，具体选择哪种药物应根据实际情况来决定。
百多邦的主要成分是莫匹罗星，属于抗生素类药物，对革兰氏阳性球菌有很强的抗菌活性，适用于脓疱疮、疖肿、毛囊炎等原发性皮肤感染，以及湿疹合并感染、溃疡合并感染、创伤合并感染等继发性皮肤感染。其优点是抗菌作用强、起效快、不良反应少。
红霉素软膏的主要成分是红霉素，属于抗生素类药物，对大多数革兰氏阳性菌、部分革兰氏阴性菌及一些非典型致病菌如衣原体、支原体均有抗菌活性。适用于脓疱疮等化脓性皮肤病、小面积烧伤、溃疡面的感染和寻常痤疮。其优点是价格便宜、使用方便。
需要注意的是，这两种药物都属于抗生素，不能滥用。使用时应按照医生的建议，根据病情选择合适的药物，并按照正确的方法使用。同时，使用过程中应注意观察有无过敏反应等不良反应，如有异常应及时就医。此外，使用抗生素可能会导致耐药菌的产生，因此应避免不必要的使用。