同房时小腹疼可能是盆腔炎、子宫内膜异位症、宫颈炎、阴道痉挛等原因所致，可以通过药物、手术等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.盆腔炎：女性上生殖道及其周围组织的炎症，主要包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿、盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，最常见的是输卵管炎、输卵管卵巢炎。主要表现为下腹痛、阴道分泌物增多，腹痛为持续性，活动或性交后加重。若病情严重可有寒战、高热、头痛、食欲缺乏。月经期发病可出现经量增多、经期延长。建议及时就医，在医生的指导下使用抗生素进行治疗，如头孢曲松钠、甲硝唑等。
2.子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的身体其他部位。异位的子宫内膜可侵犯全身任何部位，如脐、膀胱、肾、输尿管、肺、胸膜、乳腺，甚至手臂、大腿等处，但绝大多数位于盆腔脏器和壁腹膜，以卵巢、宫骶韧带最常见，其次为子宫及其他部位。主要症状为痛经、性交痛、慢性盆腔痛、月经异常等。治疗方法包括期待治疗、药物治疗、手术治疗等。
3.宫颈炎：子宫颈阴道部炎症，若未能及时治疗，可导致子宫颈管粘连，阻碍精子通过，可导致不孕症。主要表现为阴道分泌物增多，呈黏液脓性，阴道分泌物刺激可引起外阴瘙痒及灼热感。此外，可出现经间期出血、性交后出血等症状。主要治疗方法为药物治疗和物理治疗。
4.阴道痉挛：是一种因性交时阴道口或阴道周围的肌肉发生不自主的痉挛，以致阴道口或阴道狭窄，阴茎插入困难的疾病。主要表现为性交时阴道及下腹部肌肉痉挛、疼痛，以致阴道口及深部组织损伤，阴茎无法插入。主要治疗方法为心理治疗和药物治疗。
5.其他：如子宫肌瘤、卵巢肿瘤、子宫内膜息肉等，也可能导致同房时小腹疼。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免不洁性生活。可适当食用富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、牛奶、苹果、香蕉等，避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒、生姜等。