月经后第六天内射是否会怀孕，取决于女性的月经周期和排卵情况。一般来说，月经周期规律的女性，排卵日一般在下次月经来潮前的14天左右，排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天称为排卵期。在排卵期内性生活，怀孕的几率较高。如果月经周期较短，月经后第六天可能已经进入排卵期，内射怀孕的几率较大；如果月经周期较长，月经后第六天可能还处于安全期，内射怀孕的几率较小。但需要注意的是，安全期避孕法并不十分可靠，因为排卵可能受到情绪、环境等因素的影响而提前或推迟。
因此，为了避免意外怀孕，建议在性生活时采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。同时，也要注意性生活卫生，预防感染。如果出现月经推迟等情况，应及时进行验孕检查，以确定是否怀孕。