上完厕所肛门疼可能由多种原因引起。比如肛裂就比较常见，肛裂导致的肛门疼，在排便时或排便后较为明显，疼痛程度有轻有重，严重的可能会持续数小时。
肛裂导致的肛门疼
肛管皮肤裂伤： 长期便秘，大便干结粗硬，排便时过度用力撑破肛管皮肤，就会引发肛裂，出现肛门疼。一般肛裂引起的疼痛有周期性，排便时粪便刺激裂口会产生剧烈疼痛，便后有短暂缓解，之后因肛门括约肌痉挛又会出现长时间疼痛。创面感染影响： 如果肛裂创面受到细菌等感染，会加重炎症反应，让肛门疼的感觉更明显，还可能伴有分泌物增多等情况。
痔疮引发的肛门疼
内痔嵌顿： 当内痔发展到一定程度，脱出肛门外不能回纳，就会发生嵌顿，导致肛门局部血液循环障碍，出现剧烈疼痛，还能看到肛门外有肿物脱出。外痔发炎： 外痔受摩擦、感染等因素影响发炎时，会出现肛门坠胀、疼痛，用手触摸能感觉到肛门周围有肿物，且有压痛感。
肛周脓肿造成的肛门疼
细菌感染化脓： 肛门周围软组织受到细菌等病原体感染，形成脓肿，会引起持续的剧烈疼痛，疼痛部位皮肤红肿，触之有波动感，随着脓肿增大，疼痛会逐渐加重，还可能伴有发热等全身症状。炎症扩散影响： 肛周脓肿如果不及时处理，炎症可能向周围组织扩散，加重肛门局部的疼痛不适，甚至可能引发更严重的感染问题。
肛门直肠炎导致的肛门疼
炎症刺激黏膜： 直肠、肛门部位发生炎症，炎症因子刺激直肠和肛门的黏膜及周围组织，会出现肛门坠胀、疼痛，还可能伴有腹泻、大便里急后重等症状，排便后疼痛可能会有一定程度的缓解，但很快又会不适。长期炎症的影响： 慢性的肛门直肠炎长期存在，会反复刺激肛门局部，使肛门疼的情况持续或反复发作，影响患者的生活质量。