肩胛骨和上肢酸痛的原因可能有很多，以下是一些常见的原因：
1.肩周炎：肩周炎是肩关节周围炎的简称，是以肩关节疼痛和活动不便为主要症状的常见病症。其主要表现为肩部逐渐产生疼痛，夜间为甚，逐渐加重，肩关节活动功能受限而且日益加重，达到某种程度后逐渐缓解，直至最后完全复原，大概有百分之二十的患者最终会出现不同程度的肩关节粘连和功能障碍。
2.肩袖损伤：肩袖损伤多因间接暴力所致，好发于40岁以上患者，如提物、投掷、扛物等。主要表现为肩外侧疼痛，在上臂外展60°~120°时疼痛尤为明显，严重者有“扛肩”现象。
3.颈椎病：颈椎病是一种以退行性病理改变为基础的疾患，主要由于颈椎长期劳损、骨质增生，或椎间盘脱出、韧带增厚，致使颈椎脊髓、神经根或椎动脉受压，出现一系列功能障碍的临床综合征。颈椎病可导致肩背部疼痛、上肢无力、手指发麻、下肢乏力、行走困难、头晕、恶心、呕吐，甚至视物模糊、心动过速及吞咽困难等症状。
4.胸廓出口综合征：胸廓出口综合征是胸廓出口综合征是胸廓出口综合征是锁骨下动、静脉和臂丛神经在胸廓出口受压而产生的一系列症状。主要表现为患肢无力、酸痛、麻木，手指发冷、发紫等，上肢外展上举时症状加重。
5.其他：心脏疾病、肺部疾病、胆囊炎、胆囊结石等也可能会引起肩胛骨和上肢酸痛。
如果出现肩胛骨和上肢酸痛的症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。