三个月宝宝瘦小，可能是由以下原因引起的：
1.营养摄入不足：宝宝可能因为母乳不足、奶嘴孔过小或过大、喂奶时间间隔过长等原因，导致营养摄入不足。
2.消化吸收问题：宝宝可能存在乳糖不耐受、蛋白质过敏、肠道菌群失调等问题，影响营养物质的吸收。
3.疾病因素：某些疾病，如先天性心脏病、慢性腹泻、慢性肝病等，可能导致宝宝瘦小。
4.遗传因素：如果父母或家族中有瘦小的成员，宝宝可能也会受到遗传影响。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.确保充足的营养摄入：
母乳喂养：妈妈要注意饮食均衡，多吃富含蛋白质、脂肪、维生素和矿物质的食物，以保证母乳的质量。
人工喂养：选择适合宝宝年龄的配方奶粉，按照说明正确冲泡，确保宝宝能够摄入足够的营养。
添加辅食：如果宝宝已经4-6个月，可以逐渐开始添加辅食，如米粉、蔬菜泥、水果泥等，逐渐增加食物的种类和摄入量。
2.关注宝宝的消化吸收：
观察宝宝的大便情况，如有异常，及时就医。
可以咨询医生是否需要补充益生菌或其他消化酶。
3.治疗疾病：如果宝宝存在疾病，应及时就医，进行治疗。
4.定期体检：带宝宝定期去医院体检，医生会根据宝宝的情况进行评估，并给出相应的建议。
需要注意的是，每个宝宝的生长发育情况都不同，如果宝宝的瘦小问题持续存在或伴有其他异常症状，应及时咨询医生，以便获得更专业的建议和治疗。同时，家长也要保持耐心，给宝宝足够的关爱和照顾，帮助他们健康成长。