萎缩性胃炎伴肠上皮化生的治疗方法如下：
1.一般治疗：
戒烟戒酒：减少对胃黏膜的刺激。
饮食调整：避免食用辛辣、油腻、腌制、过酸等食物，多吃易消化、富含维生素的食物。
调整生活方式：保持良好的作息习惯，避免熬夜，适当运动，缓解压力。
2.药物治疗：
胃黏膜保护剂：如硫糖铝、枸橼酸铋钾等，可保护胃黏膜，促进炎症愈合。
胃酸抑制剂：如奥美拉唑、兰索拉唑等，可减少胃酸分泌，缓解症状。
促胃肠动力药：如多潘立酮、莫沙必利等，可促进胃肠蠕动，改善消化不良。
维生素：如维生素B12、叶酸等，可营养胃黏膜，有助于病情恢复。
3.根除幽门螺杆菌感染：如果幽门螺杆菌感染阳性，需进行根除治疗，常用四联疗法，即质子泵抑制剂+两种抗生素+铋剂。
4.手术治疗：
对于病情严重、药物治疗无效或出现并发症的患者，可能需要手术治疗，如胃大部切除术等。
5.中医治疗：
中药调理：根据患者的具体情况，采用中药进行调理，可缓解症状，改善体质。
针灸、按摩等：可辅助治疗，缓解不适。
需要注意的是，萎缩性胃炎伴肠上皮化生的治疗应根据患者的具体情况制定个性化的方案。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，遵医嘱用药，定期复查，以观察病情变化。同时，患者还应注意饮食和生活习惯的调整，保持良好的心态，有助于疾病的康复。