萎缩性胃炎伴中度肠上皮化生的治疗方法如下：
1.一般治疗：
戒烟戒酒，减少对胃黏膜的刺激。
饮食应规律，避免过热、过咸和辛辣食物。
避免长期服用非甾体抗炎药，如阿司匹林等。
2.药物治疗：
胃黏膜保护剂：如硫糖铝、枸橼酸铋钾等，可保护胃黏膜，促进炎症愈合。
胃酸抑制剂：如奥美拉唑、兰索拉唑等，可减少胃酸分泌，缓解症状。
维生素：如维生素B12、叶酸等，有助于改善贫血症状。
益生菌：如双歧杆菌四联活菌片等，可调节肠道菌群，改善肠道微生态。
3.中医治疗：
中药调理：根据患者的具体情况，采用辨证论治的方法，选择合适的中药方剂进行调理。
针灸、按摩等：可缓解症状，改善脾胃功能。
4.定期复查：萎缩性胃炎伴中度肠上皮化生有癌变的风险，因此需要定期复查胃镜和病理组织学检查，以便及时发现病情变化，采取相应的治疗措施。
需要注意的是，治疗方法应根据患者的具体情况制定，包括年龄、症状、病因等因素。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，同时注意饮食和生活习惯的调整，以促进病情的恢复。如果症状加重或出现其他不适，应及时就医。