跖疣初期小泡泡的治疗方法包括以下几种：
1.冷冻治疗：通过低温液氮将疣体冻死，适用于较小的跖疣。治疗后会出现水疱、血疱，通常1-2周后会自然吸收、干涸、结痂，疣体脱落。
2.激光治疗：利用激光的高温碳化疣体，适合数量较少、疣体较大的跖疣。治疗后同样会起水疱，注意保持局部干燥、清洁，避免感染。
3.外用药物治疗：可使用0.05%-0.1%维A酸软膏、5%咪喹莫特乳膏等涂抹疣体，也可以使用3%酞丁安霜或5%5-氟尿嘧啶软膏等。
4.口服药物治疗：对于疣体数量较多或病情顽固者，可口服免疫调节剂，如左旋咪唑、转移因子等，以提高机体免疫力。
需要注意的是，跖疣具有传染性，治疗期间应避免搔抓，以免传染到其他部位。同时，要保持足部清洁干燥，避免长时间走路或站立，以免加重病情。如果跖疣症状较为严重或治疗后复发，建议及时就医，在医生的指导下进行进一步治疗。此外，跖疣的治疗方法因人而异，具体治疗方案应根据个人情况而定。