双肾囊肿的病因尚不完全清楚，可能与以下因素有关。
1.先天性发育不良：这种情况是由于肾脏在胚胎时期发育异常导致的，可使肾脏内出现大小不等的囊性肿块。
2.基因突变：部分多囊肾病患者可出现基因突变，这也是导致双肾囊肿的重要原因之一。
3.后天性因素：
感染：如果肾脏受到感染，可能会导致局部组织增生，进而形成囊肿。
毒素：长期接触某些化学物质或放射性物质，可能会导致肾脏损伤，形成囊肿。
其他：高血压、糖尿病等疾病也可能增加双肾囊肿的发病风险。
需要注意的是，双肾囊肿的病因较为复杂，部分患者可能是多种因素共同作用的结果。如果出现双肾囊肿，应及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。