肛门处长疙瘩并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.痔疮：内痔或混合痔通常无明显疼痛，当发生嵌顿时则会出现疼痛。外痔发生血栓或炎症时会出现肛门部肿物，伴有疼痛。
2.肛裂：典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛裂引起的疼痛常较剧烈，多在排便时或排便后。
3.肛周脓肿：是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。其主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安。
4.肛管直肠恶性肿瘤：肛管直肠恶性肿瘤溃烂感染可引起肛门疼痛。伴有恶臭，出血和脓性分泌物。
5.血栓性外痔：肛门部突然剧烈疼痛，并出现暗紫色肿物。排便、坐下或行走时疼痛加重。
6.肛乳头炎：主要表现为肛门内间歇性疼痛，急性发作时疼痛剧烈，肛乳头脱出肛门外，肿大如乳头状。
7.肛门异物损伤：多为外伤异物残留或饮食不当，鱼刺、骨片嵌插肛管直肠所致，故需请医生仔细检查，取出异物，疼痛即能缓解。若滞留时间过长，可引起局部感染。
如果出现肛门处长疙瘩并伴有疼痛的症状，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，要注意保持肛门部清洁，避免久坐、久站，饮食清淡，避免辛辣刺激性食物。