原发性痛经的原因主要与月经时子宫内膜前列腺素含量增高有关，除此之外，原发性痛经还可能与以下因素有关：
1.精神、神经因素：部分患者对疼痛过分敏感。
2.遗传因素：女儿发生痛经与母亲痛经有一定的关系。
3.子宫发育不良：子宫发育不佳容易合并血液供应异常，造成子宫缺血、缺氧而引起痛经。
4.妇科病：如子宫内膜异位症、盆腔炎、子宫腺肌症、子宫肌瘤等。子宫内放置节育器（俗称节育环）也易引起痛经。
5.子宫颈管狭窄：主要是月经外流受阻，引起痛经。
6.子宫位置异常：若妇女子宫位置极度后屈或前屈，可影响经血通畅而致痛经。
7.遗传因素：痛经患者的母亲或姐妹常可伴有痛经。
8.内分泌因素：月经期腹痛与黄体期孕酮升高有关。
9.子宫内膜以及月经血中前列腺素（PG）含量升高：前列腺素E2（PGE2）含量升高时，会引起子宫平滑肌过强收缩，血管痉挛，造成子宫缺血、乏氧状态而出现痛经。
10.子宫的过度收缩：虽然痛经患者子宫收缩压力与正常妇女基本相同（正常者压力约为4.9Kpa），但子宫收缩持续时间较长，且往往不易完全放松，故发生因子宫过度收缩所致的痛经。
11.子宫不正常收缩：痛经患者常有子宫不正常收缩，因此往往导致子宫平滑肌缺血，子宫肌肉的缺血又可引起子宫肌肉的痉挛性收缩，从而产生疼痛而出现痛经。
12.妇科病：如子宫内膜异位症、盆腔炎、子宫腺肌症、子宫肌瘤等。子宫内放置节育器（俗称节育环）也易引起痛经。
13.压力过大：精神处于过度紧张的状态，对疼痛会更敏感，情绪的波动也会使疼痛加重。
14.作息不规律：生活作息不规律也会导致气血不畅，从而造成痛经。
15.贪吃生冷：即中医所说的寒性凝滞，食用过多寒凉生冷食品，血为寒凝，以致血行受阻，不通则痛，从而引起痛经。