小便时小肚子疼，可能与以下原因有关：
1.膀胱炎：膀胱位于小腹部位，炎症刺激可导致小腹疼痛，同时还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。膀胱炎多由细菌感染引起，可通过使用抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。此外，还需注意多饮水，以促进排尿，冲刷尿道，有助于病情恢复。
2.尿道炎：除膀胱炎外，尿道炎也可引起小便时小腹疼痛。除小腹疼痛外，还可能出现尿道口红肿、尿道分泌物等症状。治疗尿道炎通常选用头孢曲松钠、阿奇霉素等药物。
3.前列腺炎：男性前列腺紧邻膀胱，前列腺炎时炎症刺激可导致小腹疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、尿不尽、尿滴沥等排尿异常症状。前列腺炎的治疗较为复杂，需要根据具体情况选择合适的治疗方法，如药物治疗、物理治疗、手术治疗等。常用药物有盐酸坦索罗辛缓释胶囊、前列安栓等。
4.尿路结石：尿路结石可阻塞尿路，导致小便不畅，从而引起小腹疼痛。疼痛通常较为剧烈，还可能伴有血尿、恶心、呕吐等症状。较小的尿路结石可通过多饮水、多运动等方式自行排出，较大的结石则需要进行体外冲击波碎石或手术取石治疗。
5.妇科疾病：女性患者还需考虑妇科疾病的可能，如盆腔炎、宫颈炎、附件炎等，均可导致小腹疼痛，且疼痛可能在排尿时加重。治疗妇科疾病需根据具体病因进行，如使用甲硝唑、克霉唑等药物治疗炎症。
6.其他：其他原因还包括膀胱肿瘤、输尿管结石等，也可导致小便时小腹疼痛。
总之，引起小便时小肚子疼的原因较多，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、超声等，以明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。同时，在治疗期间应注意休息，多饮水，避免食用辛辣刺激性食物。