牙根发黑可能是以下原因导致的：
1.外源性色素沉着：长期吸烟、喝咖啡、饮茶等，可能会使色素沉着在牙齿表面，导致牙根发黑。此外，长期使用某些药物，如四环素类抗生素，也可能导致牙齿着色。
2.龋齿：如果牙齿龋坏，会导致牙齿局部颜色改变，呈现黑色或棕色。
3.牙髓坏死：牙齿受到外伤、龋齿等原因，导致牙髓坏死，血液中的血红蛋白分解产物会进入牙本质小管，使牙齿颜色变黑。
4.牙结石：牙结石是附着在牙齿表面的钙化物质，通常呈黄色或棕色，也可能导致牙根发黑。
5.其他：牙根发黑还可能与年龄增长、牙齿发育异常等因素有关。
牙根发黑可能会影响牙齿的美观，严重的情况下还可能导致牙齿松动、脱落等问题。如果发现牙根发黑，建议及时就医，进行口腔检查和治疗。医生会根据具体情况，采取洁牙、补牙、根管治疗等方法，以恢复牙齿的健康和美观。
此外，为了保持口腔健康，建议定期进行口腔检查，每天早晚刷牙，使用牙线、漱口水等辅助清洁工具，避免吸烟、饮酒等不良习惯，减少食用深色食物和饮料。