怀孕初期肚子疼且伴有血丝，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：在怀孕初期，胚胎着床不稳定，过度劳累、性生活、孕酮水平低等因素可能导致先兆流产，出现肚子疼和少量阴道流血。此时需要卧床休息，及时就医，医生一般会使用黄体酮等药物进行保胎治疗。
2.宫外孕：受精卵在子宫以外的部位着床，称为宫外孕。宫外孕可能导致肚子疼和阴道流血，严重时可能引起大出血，甚至危及生命。宫外孕需要通过超声检查等方式及时确诊，并采取相应的治疗措施，如手术或药物治疗。
3.葡萄胎：葡萄胎是一种异常妊娠，是由于受精卵异常发育导致的。患者会出现停经后阴道流血、肚子疼等症状，B超检查可协助诊断。一旦确诊，需要及时进行清宫手术，并定期复查。
4.其他原因：怀孕初期肚子疼且伴有血丝还可能与宫颈息肉、子宫黏膜下肌瘤等因素有关。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要通过详细的检查和诊断来确定。如果怀孕初期出现肚子疼和阴道流血，应及时就医，进行相关检查，如血HCG、孕酮、B超等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇应注意休息，避免劳累和性生活，保持心情舒畅，按照医生的建议进行产前检查。