月经刚结束时同房后出现褐色分泌物，可能与以下因素有关。
1.残留经血：月经刚结束时，子宫内膜尚未完全修复，同房可能导致子宫收缩，将残留的经血排出，从而出现褐色分泌物。
2.子宫内膜未修复好：月经刚结束时，子宫内膜还比较脆弱，同房时可能会刺激子宫，导致子宫内膜再次出血，出现褐色分泌物。
3.妇科疾病：如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、子宫肌瘤等，也可能导致同房后出现褐色分泌物。
4.其他：如内分泌失调、放置宫内节育器等。
如果只是偶尔出现一次这种情况，一般不需要特殊处理，注意观察即可。但如果经常出现这种情况，或者伴有其他不适症状，如腹痛、瘙痒、异味等，应及时就医，进行相关检查，如白带常规、B超等，以明确原因，并进行针对性治疗。
此外，需要注意的是，月经期间应避免同房，因为此时子宫内膜脱落，宫颈口张开，同房容易导致感染，引起妇科炎症。同时，同房时应注意卫生，保持外阴清洁。如果暂时没有生育需求，应做好避孕措施，避免意外怀孕。