月经刚结束时，子宫腔表面仍有断裂的血管和腺管，微小血管还会有渗血的情况，新的子宫内膜也才开始生长，表面还没有上皮覆盖。此时同房，在同房刺激时可引起子宫收缩，就可能导致子宫内膜再次出血，出现褐色分泌物。这种情况一般持续1-3天，是正常的生理现象，通常不需要就医或采取其他措施。
但需要注意的是，以下情况也可能导致月经刚结束同房后有褐色分泌物：
妇科疾病：如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、子宫肌瘤、子宫内膜异位症等，这些疾病可能会导致阴道出血，血液在阴道内停留时间较长，就会呈现出褐色。
内分泌失调：如果女性长期压力过大、精神紧张、作息不规律等，可能会导致内分泌失调，从而影响月经周期和月经量。
其他：服用紧急避孕药、放置宫内节育器等也可能导致月经刚结束同房后有褐色分泌物。
如果褐色分泌物持续时间较长、出血量较多、伴有腹痛、瘙痒等不适症状，或者经常出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，如白带常规、B超、性激素六项等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。
此外，为了保持生殖系统的健康，建议在月经期间避免同房，同时注意个人卫生，勤换内裤，保持外阴清洁。同房时也要注意卫生，避免感染。如果暂时没有生育需求，建议做好避孕措施，避免意外怀孕。