引起大拇指指甲凹陷的原因有很多，常见的包括：
1.营养不良：指甲是由蛋白质组成的，如果身体缺乏蛋白质、维生素或矿物质等营养物质，指甲就可能出现凹陷。这种情况通常与饮食不均衡、消化吸收问题或某些疾病有关。
2.真菌感染：指甲受到真菌感染，如灰指甲，可能导致指甲变形、凹陷。此外，还可能伴有指甲变色、增厚、易碎等症状。
3.银屑病：银屑病是一种自身免疫性疾病，除了皮肤症状外，也可能影响指甲，导致指甲凹陷、畸形。
4.扁平苔藓：扁平苔藓是一种慢性炎症性皮肤病，有时会累及指甲，引起指甲凹陷、变薄。
5.外伤：指甲受到外力撞击、挤压或过度磨损等，可能导致指甲下的组织受损，引起凹陷。
6.疾病：某些系统性疾病，如缺铁性贫血、心脏病、糖尿病等，也可能导致指甲凹陷。
7.遗传因素：某些遗传疾病或基因突变可能导致指甲发育异常，出现凹陷。
如果发现大拇指指甲凹陷，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会进行身体检查、实验室检查或其他特殊检查，根据结果制定相应的治疗方案。
此外，保持良好的营养摄入、避免指甲受伤、保持指甲清洁卫生等，也有助于预防指甲凹陷的发生。如果指甲凹陷伴有其他症状或持续不愈，应及时就医诊治。对于特定人群，如孕妇、老年人或患有基础疾病的人，指甲凹陷可能与特定健康问题相关，应特别关注并咨询医生的建议。