肚脐眼有水且发臭，可能是由以下原因引起：
1.感染：肚脐眼是一个容易藏污纳垢的部位，若平时不注意清洁，容易导致细菌感染，引起肚脐眼炎。肚脐眼炎可导致肚脐眼红肿、流水、发臭等症状。
2.湿疹：湿疹是一种常见的皮肤病，可发生在身体的任何部位，包括肚脐眼。湿疹可导致肚脐眼潮湿、瘙痒、流水、发臭等症状。
3.脐尿管瘘：脐尿管瘘是一种先天性疾病，是由于脐尿管未完全闭合导致的。脐尿管瘘可导致肚脐眼流水、发臭，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
4.其他：其他原因还包括脐疝、恶性肿瘤等。
如果出现肚脐眼有水且发臭的情况，建议及时就医，明确诊断。医生会根据具体情况进行相应的治疗，如局部清洁、使用抗生素、手术治疗等。同时，要注意保持肚脐眼的清洁干燥，避免搔抓和刺激。