早上起来小便刺痛，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是一种常见的泌尿系统感染，可导致尿道口红肿、疼痛，排尿时疼痛加剧。尿道炎可由细菌、病毒、支原体等感染引起。常见的症状还包括尿频、尿急、尿道口分泌物等。治疗尿道炎通常采用抗生素治疗，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，应注意多饮水，促进排尿，有助于缓解症状。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，也可引起小便刺痛。除了尿痛，还可能伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎相似，主要是使用抗生素。此外，保持良好的个人卫生习惯，避免憋尿，也是预防膀胱炎的重要措施。
3.前列腺炎：男性患者中，前列腺炎也可能导致早上起来小便刺痛。前列腺炎可分为急性和慢性两种，除了尿痛，还可能伴有会阴部、腰骶部疼痛，性功能障碍等症状。治疗前列腺炎需要根据具体情况选择合适的方法，如药物治疗、物理治疗等。
4.其他原因：泌尿系统结石、尿道口息肉、尿道口狭窄等也可能引起小便刺痛。此外，过度清洁尿道口、性生活过于频繁等也可能导致尿道口黏膜损伤，引起疼痛。
如果出现早上起来小便刺痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免过度劳累，多饮水，多排尿，有助于预防泌尿系统感染的发生。