怀孕三个月肚子右边疼，可能是正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长。在这个过程中，子宫周围的韧带会被拉伸，可能会引起肚子右边疼。这种疼痛通常是轻微的，并且会随着孕周的增加而逐渐缓解。孕妇可以通过休息、改变体位、热敷等方式来缓解疼痛。
2.子宫收缩：在怀孕早期，子宫会出现不规则的收缩，称为假性宫缩。这些收缩可能会引起肚子右边疼，但通常不会持续很长时间，也不会导致子宫颈口张开。孕妇可以通过放松、深呼吸等方式来缓解疼痛。
3.阑尾炎：阑尾炎是一种常见的腹部疾病，其疼痛通常开始于上腹部或肚脐周围，然后逐渐转移到右下腹。孕妇如果出现转移性右下腹疼痛，伴有恶心、呕吐、发热等症状，应考虑阑尾炎的可能。治疗方法通常是手术切除阑尾。
4.右侧附件炎：右侧附件炎是指右侧卵巢和输卵管的炎症。炎症可能导致肚子右边疼、发热、白带异常等症状。治疗方法通常是使用抗生素进行抗感染治疗。
5.右侧输尿管结石：右侧输尿管结石可能导致右侧腰部或腹部疼痛，疼痛可能向会阴部放射。孕妇如果出现血尿、尿频、尿急等症状，应考虑右侧输尿管结石的可能。治疗方法通常是保守治疗或手术治疗。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因和治疗方法，具体情况需要根据孕妇的具体情况进行诊断和治疗。如果孕妇肚子右边疼持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，以便早期诊断和治疗。