甲状腺疾病属于内分泌系统疾病，应前往内分泌科就诊。但部分医院可能没有单独的内分泌科，此时可选择外科就诊。此外，一些三甲医院还设有甲状腺专科，也可前往该科室进行诊断和治疗。
如果已经确诊甲状腺疾病，在治疗过程中可能需要进行相关检查和治疗，以下是一些可能涉及的科室：
1.核医学科：用于检测甲状腺功能、进行甲状腺放射性核素治疗等。
2.病理科：对甲状腺疾病进行病理诊断，确定疾病的类型和严重程度。
3.放疗科：对于甲状腺癌等恶性肿瘤，可能需要进行放疗。
4.超声科：进行甲状腺超声检查，评估甲状腺的结构和功能。
需要注意的是，具体的科室选择可能因医院的科室设置和医生的专业特长而有所不同。在就诊时，最好向医院咨询或请医生根据具体情况进行推荐。
此外，对于一些特殊情况，如妊娠期甲状腺疾病、儿童甲状腺疾病等，可能需要妇产科、儿科等相关科室的协同治疗。
总之，甲状腺疾病的科室选择应根据具体情况而定，建议在就诊前咨询医院或医生，以便得到最专业的诊断和治疗。