注射用奥美拉唑钠的副作用有：
1.神经系统：可有头痛、头晕、嗜睡、外周神经炎等。
2.代谢/内分泌系统：长期或大量使用奥美拉唑可引起维生素B₁₂缺乏。
3.肌肉骨骼系统：可有肌肉痛、关节痛、肌痛、乏力等。
4.泌尿系统：可有间质性肾炎、急性肾损伤。
5.皮肤：可有皮疹、瘙痒、剥脱性皮炎等。
6.其他：可有发热、寒战、肝功能异常、白细胞减少、血小板减少等。
以上副作用并非都会发生，具体情况因个体差异而异。使用注射用奥美拉唑钠期间，应密切观察身体状况，如有不适及时告知医生。此外，使用该药物时需要注意以下几点：
1.对奥美拉唑钠、其他苯并咪唑类化合物过敏者禁用，过敏体质者慎用。
2.使用前应详细询问患者的用药史，避免与其他药物同时使用。
3.本品不宜与其他药物混合输注。
4.肾功能不全者慎用，肝功能不全者无需调整剂量。
5.孕妇及哺乳期妇女慎用。
如果正在使用其他药物，使用本品前请咨询医生或药师。