肚脐眼上方3-5厘米处的疼痛，可能与多种原因有关。以下是一些可能的原因：
1.胃部疾病：胃溃疡、胃炎等胃部疾病可能导致肚脐眼上方疼痛。疼痛通常在进食后出现，可能伴有恶心、呕吐、腹胀等症状。
2.十二指肠疾病：十二指肠溃疡等疾病也可能引起该部位疼痛。疼痛通常在空腹或夜间出现，可能伴有烧心、反酸等症状。
3.胰腺疾病：胰腺炎、胰腺癌等胰腺疾病也可能导致肚脐眼上方疼痛。疼痛可能较为剧烈，伴有恶心、呕吐、发热等症状。
4.肝脏和胆囊疾病：肝炎、胆囊炎、胆结石等疾病也可能引起该部位疼痛。疼痛可能向右肩部放射，伴有黄疸、发热等症状。
5.肠道疾病：肠梗阻、肠痉挛、肠炎等肠道疾病也可能导致肚脐眼上方疼痛。疼痛可能伴有腹泻、便秘、肠鸣音亢进等症状。
6.其他原因：肋软骨炎、胸膜炎、心脏疾病等也可能引起该部位疼痛。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，进行相关检查，如胃镜、腹部超声、心电图等，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
此外，女性患者还需要考虑妇科疾病的可能，如盆腔炎、附件炎等。疼痛可能伴有白带异常、月经失调等症状。
需要注意的是，肚脐眼上方3-5厘米处的疼痛原因较为复杂，需要根据具体情况进行综合分析。在就医前，应避免自行服用止痛药，以免掩盖病情。同时，应注意休息，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物。