大便出血肛门疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
肛裂引起的疼痛：肛裂引起的疼痛多剧烈，有典型的周期性。排便时，粪便刺激溃疡面的神经末梢，导致肛门内括约肌痉挛，产生疼痛。便后数分钟，疼痛缓解，此后因肛门内括约肌持续性痉挛而再次剧痛，此期可持续半到数小时，临床称为疼痛间歇期。当肛门括约肌疲劳、松弛后，疼痛缓解，但再次排便时，疼痛又会出现。
肛裂引起的便血：肛裂便血不规则，时有时无，与排便有关系，由于肛裂的创面是开放的，病菌易从创面进入引发感染，因此，裂口越大、越深，出血越多。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，均可出现不同程度的肛门疼痛。
内痔或混合痔的症状：内痔或混合痔发展到一定程度即能脱出肛门外，内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，均可出现不同程度的肛门疼痛。
3.肛管直肠损伤：多为裂伤或切伤，可引起肛门疼痛及出血。
4.肛门直肠周围脓肿：起病急，且容易误诊。由于部分脓肿位置较深，病变多发生在植物神经支配的区域，疼痛不明显，表现为坠胀、坠痛或直肠刺激症状，可伴有全身症状。
5.肛窦炎：肛窦炎是引起肛门部下坠感的主要原因。此外，肛窦与肛瓣发炎也叫肛隐窝炎，进一步可发展成肛周脓肿。
6.血栓性外痔：轻者有异物感，大多伴有胀痛。由于肛周静脉血管破损，血块凝结而成血栓，在肛门外皮下出现青紫圆形硬结节，一般在截石位3点、9点处。
7.直肠癌：肛门出血，血色鲜红或暗红，表现为大便习惯改变，次数增多或便秘，有下坠感，大便变细，并有少量黏液血便。后期可出现大便变稀，伴肛门直肠下坠、肛门疼痛，甚至出现腹部、骶部疼痛。
8.其他：肛管直肠恶性肿瘤、溃疡性结肠炎、克隆恩病等也可引起肛门疼痛和出血。
如果出现大便出血肛门疼痛的症状，建议及时就医，明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，应注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物，保持大便通畅，预防便秘和腹泻。