大便出血且肛门疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。肛门视诊可发现肛裂三联征，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.痔疮：内痔和混合痔可出现便血，通常为鲜红色，表现为便后滴血或喷射状出血。内痔或混合痔发展到一定程度时，可出现内痔脱出，伴有肛门疼痛。肛门视诊或直肠指诊有助于诊断。
3.肛管或直肠损伤：肛管或直肠受到外伤或器械检查时的损伤，可导致大便带血和肛门疼痛。
4.直肠息肉：是直肠黏膜表面突出的赘生物，通常为单个或多个，颜色鲜红，质软，无疼痛，大便时可脱出肛门外，便后可自行缩回。直肠指诊或结肠镜检查有助于诊断。
5.直肠肿瘤：直肠癌或肛管癌可出现大便带血，颜色可鲜红或暗红，伴有肛门疼痛、肛门坠胀感、大便习惯改变等症状。肛管或直肠指诊、结肠镜检查及病理活检可明确诊断。
6.其他：溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核等肠道炎症性疾病，缺血性肠病，肛瘘，肛门脓肿等也可引起大便出血和肛门疼痛。
需要注意的是，大便出血和肛门疼痛可能是严重疾病的表现，如直肠癌等，因此如果出现这种症状，应及时就医，进行详细的检查，以明确诊断并采取相应的治疗措施。此外，保持良好的饮食习惯和生活习惯，如多吃蔬菜水果，避免久坐，保持大便通畅等，有助于预防肛肠疾病的发生。