男性小便刺痛能否自愈，取决于引起刺痛的原因。以下是一些可能的情况：
1.尿道炎：
非淋球菌性尿道炎：由支原体、衣原体感染引起，多通过性接触传播。除小便刺痛外，还可能伴有尿道分泌物。这种情况下，尿道炎通常需要治疗，自愈的可能性较小。
淋球菌性尿道炎：由淋病奈瑟菌感染引起，主要通过性接触传播。患者会出现尿频、尿急、尿痛、尿道口红肿、脓性分泌物等症状。淋球菌性尿道炎需要及时就医，使用抗生素进行治疗，如大观霉素、头孢曲松等。如果不及时治疗，可能会导致炎症扩散，引起附睾炎、前列腺炎等并发症。
2.膀胱炎：
非特异性膀胱炎：由细菌感染引起，也可能与化学因素、免疫因素等有关。患者会出现尿频、尿急、尿痛、下腹部疼痛等症状。非特异性膀胱炎通常需要使用抗生素进行治疗，如左氧氟沙星、阿莫西林等。如果治疗不彻底，容易反复发作。
间质性膀胱炎：病因尚不明确，可能与自身免疫、感染、神经源性等因素有关。患者会出现尿频、尿急、尿痛、耻骨上区疼痛等症状，疼痛在排尿后加重。间质性膀胱炎的治疗较为困难，目前主要采用药物治疗、物理治疗、手术治疗等综合方法。
3.前列腺炎：
急性前列腺炎：由细菌感染引起，多由尿道上行感染所致，也可经血行感染或经淋巴感染引起。患者会出现尿频、尿急、尿痛、排尿困难、会阴部疼痛等症状。急性前列腺炎需要及时就医，使用抗生素进行治疗，如左氧氟沙星、头孢呋辛酯等。如果治疗不及时，可能会发展为慢性前列腺炎。
慢性前列腺炎：病因较为复杂，可能与病原体感染、排尿功能障碍、精神心理因素等有关。患者会出现尿频、尿急、尿痛、排尿困难、会阴部疼痛、性功能障碍等症状。慢性前列腺炎的治疗较为困难，需要综合治疗，包括药物治疗、物理治疗、心理治疗等。
4.其他原因：
泌尿系统结石：如肾结石、输尿管结石、膀胱结石等，可能会导致小便刺痛。较小的结石可以通过多喝水、多运动等方式自行排出体外。较大的结石则需要进行体外冲击波碎石、手术取石等治疗。
泌尿系统肿瘤：如膀胱癌、前列腺癌等，也可能会导致小便刺痛。这种情况下，通常需要进行手术治疗、化疗、放疗等综合治疗。
总之，男性小便刺痛可能是一种疾病的表现，需要及时就医，明确病因，进行针对性治疗。在治疗期间，应注意休息，多喝水，避免憋尿，保持尿道口清洁。同时，应避免食用辛辣、刺激性食物，避免饮酒。