乙肝病毒携带者可以办理健康证。乙肝病毒携带者是指感染了乙肝病毒，但没有肝炎症状和体征，肝功能等各项检查正常，肝脏组织学检查一般无明显异常的群体。
根据《食品安全法》及其实施条例规定，患有病毒性肝炎的人员不得从事接触直接入口食品的工作。这里的“病毒性肝炎”包括甲肝、戊肝和乙肝。但乙肝病毒携带者通常肝功能正常，肝脏损害较轻，不属于上述法律规定的禁止从事接触直接入口食品工作的情形。因此，乙肝病毒携带者可以办理健康证，但需要注意以下几点：
1.提供真实的健康信息：在办理健康证时，应如实告知自己的健康状况，包括是否为乙肝病毒携带者。如果故意隐瞒病情，可能会导致健康证失效，甚至承担法律责任。
2.配合相关检查：办理健康证时，可能需要进行肝功能、乙肝五项等检查。应按照医生的要求进行检查，以确保检查结果的准确性。
3.注意个人卫生：乙肝病毒主要通过血液、性接触和母婴传播，日常生活中应注意个人卫生，避免与他人共用牙刷、剃须刀等可能导致血液传播的物品。同时，应避免饮酒、过度劳累等，以免加重肝脏负担。
4.定期复查：乙肝病毒携带者应定期复查肝功能、乙肝五项、乙肝病毒DNA等指标，以便及时发现病情变化，采取相应的治疗措施。
总之，乙肝病毒携带者可以办理健康证，但在办理和使用健康证时，应遵守相关规定，注意个人卫生，定期复查，以保护自己和他人的健康。