外毒素和内毒素的来源、化学成分、稳定性、抗原性、致病作用和治疗方法均不同。
外毒素与内毒素的区别如下：
一、来源不同
1.外毒素：是某些细菌在生长过程中，分泌到细胞外面的一种代谢产物。
2.内毒素：是革兰氏阴性细菌细胞壁中的一种成分，当细菌死亡或自溶后，才会释放出来。
二、化学成分不同
1.外毒素：主要是蛋白质，其毒性作用强，对组织器官有选择性毒害效应，引起特殊的临床表现和严重的病理变化。
2.内毒素：是脂多糖，其毒性作用相对较弱，不会引起特异性的临床表现，但可以引起发热、白细胞增多等全身性反应。
三、稳定性不同
1.外毒素：不稳定，易被热、酸、碱等破坏。
2.内毒素：较稳定，耐热、耐酸，不易被破坏。
四、抗原性不同
1.外毒素：强，可刺激机体产生抗毒素。
2.内毒素：弱，不能刺激机体产生抗毒素，但可引起机体的免疫应答。
五、致病作用不同
1.外毒素：主要是通过与靶细胞表面的受体结合，进入细胞内，发挥毒性作用。
2.内毒素：主要是通过激活机体的免疫系统，产生炎症反应和免疫应答，从而导致疾病的发生。
六、治疗方法不同
1.外毒素：可以使用抗毒素进行中和解毒。
2.内毒素：可以使用抗生素进行治疗。