根据验孕棒检测结果为二条杠且第二天月经来了的情况，可能存在以下几种原因：
1.验孕棒假阳性：验孕棒可能出现假阳性的情况，即检测结果出现错误。如果对验孕棒的结果存在疑虑，可以选择再次检测或去医院进行检查，以确保结果的准确性。
2.生化妊娠：指精卵结合了，一般精卵结合七天以后就要分泌绒毛膜促性腺激素，再过七天以后，用早孕试纸就可以测出来，往往精卵结合了，但是没有回到子宫里着床，或者是回来了，没有着上床，这种叫生化妊娠。这种情况在医学上称为“亚临床流产”，即没有临床妊娠，现在医学上称此症状为“亚临床流产”，该现象在自然流产中占一定比例。生化妊娠一般不会影响下一次的怀孕。不需要特殊处理，也不需要卧床休息。
3.先兆流产：如果确定是怀孕了，后来又来月经了，量少、色黯、有血块，伴有腹痛或腰酸下坠，这可能是先兆流产的表现。需要及时就医，进行保胎治疗。
4.异位妊娠：即宫外孕，指孕卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程。以输卵管妊娠最常见。病因常由于输卵管管腔或周围的炎症，引起管腔通畅不佳，阻碍孕卵正常运行，使之在输卵管内停留、着床、发育，导致输卵管妊娠流产或破裂。在流产或破裂前往往无明显症状，也可有停经、腹痛、少量阴道出血。一旦破裂，则表现为急性剧烈腹痛，反复发作，阴道出血，甚至休克。需要及时就医，根据具体情况选择手术治疗或药物治疗。
5.其他：还可能是其他原因引起的阴道出血，如宫颈息肉、宫颈癌、子宫肌瘤等。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要根据个人的具体情况和医生的诊断来确定。如果对自己的身体状况有任何疑虑或担忧，建议及时咨询医生或妇科专家，以获得更专业的建议和治疗。