以上人群通常不建议做无痛肠镜，包括肛管直肠狭窄、急性炎症病变、妊娠期妇女、年老体衰者、腹部或盆腔手术后早期患者、慢性结肠炎且伴有肠腔狭窄及营养不良者、腹膜炎和肠穿孔等重症患者。
以下这些人群通常不建议做无痛肠镜：（一）肛管直肠狭窄、内窥镜无法插入时，不宜做无痛肠镜，否则容易引起严重的损伤；（二）肛管直肠急性炎症病变时，如肛裂、肛周脓肿等，因为可能导致炎症扩散，应在炎症消退后再行检查；（三）妇女妊娠期，应避免进行无痛肠镜检查，以免对胎儿造成影响；（四）年老体衰、严重高血压、贫血、冠心病、心肺功能不全者，无痛肠镜检查风险较大，应慎重考虑是否进行；（五）腹部或盆腔手术后早期，尤其是有肠粘连者，应避免进行无痛肠镜检查，以免引起严重的腹痛；（六）慢性结肠炎，且伴有肠腔狭窄及营养不良者，此类患者做无痛肠镜检查需谨慎；（七）腹膜炎、肠穿孔等重症患者，做无痛肠镜检查可能会加重病情，应在病情稳定后再考虑。