知柏地黄丸和杞菊地黄丸在药物成分、功效侧重、适用病症上存在差异，前者由知母、黄柏等组成，侧重滋阴清热，适用于阴虚火旺明显病症；后者由枸杞子、菊花等组成，侧重滋肾养肝，适用于肝肾阴亏且眼部症状突出病症，使用时应根据自身情况在医生指导下选择。
知柏地黄丸和杞菊地黄丸的区别主要体现在以下几个方面：
1.药物成分：知柏地黄丸主要由知母、黄柏、熟地黄、山茱萸（制）、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻组成；杞菊地黄丸则是由枸杞子、菊花、熟地黄、酒萸肉、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻组成。
2.功效侧重：知柏地黄丸侧重于滋阴清热，主要用于阴虚火旺，潮热盗汗，口干咽痛，耳鸣遗精，小便短赤等症；杞菊地黄丸侧重于滋肾养肝，主要用于肝肾阴亏，眩晕耳鸣，羞明畏光，迎风流泪，视物昏花等症。
3.适用病症：知柏地黄丸适用于阴虚火旺较为明显的病症；杞菊地黄丸适用于肝肾阴亏，以眼部症状如视物昏花、迎风流泪等较为突出的病症。
总之，虽然知柏地黄丸和杞菊地黄丸都是滋阴补肾的中成药，但在成分、功效和适用病症上存在一定的差异。在使用时，应根据自身的具体症状和体质，在医生的指导下选择合适的药物进行治疗。