头后仰时脖子根部疼痛可能由颈椎退行性改变、过度疲劳、外伤、颈椎小关节错位等原因引起，出现该症状建议及时就医检查诊断，以确定病因并采取相应治疗措施。
头后仰时脖子根部疼痛，可能由以下几种原因引起：
1.颈椎退行性改变：颈椎部位的韧带可能会出现肥厚、钙化、炎症等病变。这些变化会影响到颈椎的正常功能，当头部后仰时，可能会牵拉到病变的韧带，从而引起脖子根部疼痛。
2.过度疲劳：颈部过度活动会导致肌肉、肌腱疲劳。当头部后仰时，这些疲劳的肌肉和肌腱可能会受到进一步的牵拉，引发疼痛。
3.外伤：脖子根部遭受直接暴力打击，或者颈部被动过度背伸，可能会导致肌肉、肌腱或骨骼损伤。这种情况下，头后仰时会加重损伤部位的压力，导致疼痛加剧。
4.颈椎小关节错位：颈椎的小关节错位会影响颈部的活动，在活动颈部时，包括头后仰的动作，可能会引起相关部位的疼痛。
如果出现头后仰时脖子根部疼痛的症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便确定具体的病因，并采取相应的治疗措施。