男性生殖器疱疹初期症状主要有皮损表现、全身症状和其他症状，其中皮损表现为患处先有烧灼感，然后出现红斑，继之在红斑的基础上发生多群红色丘疹，水疱变为脓性，破后可形成糜烂，最后结痂痊愈；全身症状表现为发热、头痛、乏力等；其他症状表现为尿道、阴道分泌物及排尿困难，直肠疼痛、便秘、分泌物增加及性交痛。
男性生殖器疱疹初期症状主要有以下几点：
一、皮损表现
1.原发性生殖器疱疹：从感染到发病一般为35天，患处先有烧灼感，然后出现红斑，继之在红斑的基础上发生多群红色丘疹，并感到热痒，不久即可变成小水庖，数日后水疱变为脓性，破后可形成糜烂，最后可结痂痊愈。整个病程1520天。
2.复发性生殖器疱疹：大约有60%的原发患者，会在一年内再次复发，第1年至少复发数次，第2年则逐渐减少。复发后一般症状比较轻，也没有淋巴结肿大，病程也短。引起复发的诱因，多为感冒、发烧、上火、月经来潮、性交过频、疲劳过度、消化不良和气候干燥等。复发时，患处可感到有热刺和痒感。
二、全身症状
患者常有发热、头痛、乏力等不适感，在腹股沟处淋巴结亦常肿大。
三、其他症状
生殖器疱疹亦可出现尿道、阴道分泌物及排尿困难，直肠疼痛、便秘、分泌物增加及性交痛。