头疼做CT还是磁共振，需要根据具体情况来决定。以下是一些需要考虑的因素：
1.病因：如果头疼是由于外伤、脑出血、脑肿瘤等原因引起，CT可能是首选的检查方法。CT可以快速扫描头部，检测是否有颅骨骨折、颅内出血、脑肿瘤等异常。磁共振成像（MRI）则对软组织的分辨力更高，可以更清楚地显示脑部的结构和病变，但检查时间较长，对于急重症患者可能不太适合。
2.病史和症状：医生会询问头疼的特点、发作频率、加重或缓解因素等。如果头疼伴有神经系统症状，如肢体无力、麻木、言语不清、抽搐等，或者有其他潜在的健康问题，如心脏病、糖尿病等，MRI可能更有助于进一步评估。
3.其他检查结果：如果已经进行了其他检查，如脑电图（EEG）、腰椎穿刺等，医生会根据这些结果来决定是否需要进一步做CT或MRI。
4.个人情况：某些情况下，如怀孕、幽闭恐惧症等，可能不适合进行MRI检查。此外，CT和MRI都有一定的辐射，对于儿童、备孕或怀孕的女性等特殊人群，医生可能会更倾向于选择其他无辐射的检查方法。
需要注意的是，头疼的原因可能是多种多样的，有时可能需要综合多种检查方法来明确诊断。医生会根据具体情况制定个性化的检查方案，并结合其他临床表现和检查结果来做出准确的诊断和治疗决策。
如果头疼严重或持续不缓解，建议及时就医，以便获得适当的诊断和治疗。在等待检查结果期间，应注意休息，避免过度劳累和压力，保持良好的生活习惯。